OLIVIER LICHTARGE, Ph.D.
Objet de la recherche
Le laboratoire du professeur Lichtarge combine expérimentation et informatique afin d’étudier trois aspects de la relation structure-fonction des protéines : les bases moléculaires de la catalyse et des interactions protéines:protéines, le design de peptides et de protéines et l’annotation de séquences et de structures protéiques.
L’objectif à long terme est de concevoir des protéines ou des peptides artificiels afin d’analyser puis de perturber de façon rationnelle les réseaux de protéines.
Importance de la recherche
Identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et, éventuellement, de mettre au point de nouvelles approches pour le développement d’agents thérapeutiques.
Afin de guider nos expériences, nous effectuons à l’aide d’outils informatiques une analyse intégrée de l’évolution des séquences, des structures et des fonctions des protéines d’intérêt. Cette approche phylogénomique est appelée Evolutionary Trace (ET); elle consiste à assigner à chacun des acides aminés de la protéine un score d’importance fonctionnelle. Ceci permet de formuler des hypothèses quant à l’identité des déterminants moléculaires de l’activité et de la spécificité d’une protéine ainsi que de cibler expérimentalement et de façon rationnelle ses sites les plus importants.
Les projets en cours portent sur la finition et l’automatisation de l’approche Evolutionary Trace, sur l’annotation informatique de la fonction protéique et sur l’intégration de données à l’échelle protéomique. Expérimentalement, nous nous concentrons sur les mécanismes moléculaires de la signalisation par les protéines G, les récepteurs nucléaires et les kinases. Nous travaillons également, en collaboration, sur les interactions entre les produits de gènes essentiels chez la bactérie. Comme toutes ces protéines présentent un intérêt pharmaceutique, nous espérons que l’analyse informatique, alliée au design rationnel, permettra d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et, éventuellement, de mettre au point de nouvelles approches pour le développement d’agents thérapeutiques.
<< Retour à la liste des chercheurs
