La plateforme de Bio-informatique propose des services de développement algorithmique et d’analyses personnalisées de méga données, la gestion des bases de données et le développement de logiciels. Elle représente un atout important pour l’analyse des données générées par les différents groupes de recherche et sert de support technologique pour les autres plateformes de l’Institut.
Intimement liée à la plateforme de Génomique, elle inclut l’ensemble des travaux d’analyse de séquençage de nouvelle génération tels que l’assemblage sur génome de référence ou de novo de données de reséquençage, le transcriptome ou la capture d’exome, les analyses d’expression différentielles ou encore la détection de mutations.
La plateforme collabore aussi étroitement aux travaux réalisés en protéomique, chimie computationnelle, criblage à haut débit, et en biologie in vivo. Elle propose aussi des formations personnalisées sur différents thèmes reliés à la programmation et à l’analyse de données.
Services offerts :
- Analyses de données (massives ou non)
- Développement logiciel
- Design, implantation et maintien de bases de données et interfaces usagers
- Analyses statistiques
- Automatisation et parallélisation d’algorithmes
Équipement
Grappe de calcul
- Noeuds de calcul CPU totalisant 1500 coeurs, 10To de mémoire
- Capacité totale de 50 GPU
- Interconnexions 10Gbit
Espace de stockage
- Unités de stockage SAN d’une capacité de 1,800To
- Serveurs de base de données dédiés
- Protection des données à l’aide d’une unité de sauvegarde robotisé de plus de 2,600To
Hébergement
- Grappe de serveurs hébergeant plus d’une centaine de machines virtuelles applicatives et de calcul
Logiciels développés
Réalisations sélectionnées
– Logiciel de gestion des colonies animales: https://vivarium.umontreal.ca
– Logiciel de gestion des équipements scientifiques, réservation et facturation: https://gps.iric.ca
– Base de données de la cohorte AML Leucegege: https://data.leucegene.iric.ca
– Portail de la plate-forme de génomique: https://genomique.iric.ca
– Portail de gestion du recrutement étudiant: https://aa.iric.ca