La plateforme ChemoGenix effectue des criblage combinés CRISPR/Cas9 KO à l’échelle du génome faits en présence de composés inhibant la croissance cellulaire. De tels criblages identifient en une seule expérience l’ensemble des gènes humains qui, suivant leur perte de fonction, créent une résistance ou une sensibilité accrue au composé. L’identité de ces gènes permet en retour de découvrir ou confirmer le mécanisme d’action du composé, de lui trouver d’éventuels effets secondaires, de découvrir de nouvelles fonctions de gènes reliés à l’activité du composé ou de prédire quels autres composés pourraient agir en synergie avec le composé criblé.
L’Université de Montréal détient deux licences CRISPR (ERS Genomics et Broad Institute), ce qui permet à la plateforme ChemoGenix d’effectuer des cribles à la fois pour le secteur industriel et le secteur académique.
Nos clients sont facturés à des prix servant seulement à couvrir nos frais d’opérations avec comme entente que les résultats générés deviendront publiquement accessibles sur le site web de la plateforme 3 ans après avoir été générés. Cette stratégie a pour but de supporter toute la communauté scientifique en établissant une vaste base de données de signatures chimio-génomiques humaines accessible à tous. À l’inverse, cette politique ne s’applique pas à nos clients industriels pour lesquels les résultats demeureront confidentiels.
Jusqu’à présent, ChemoGenix a criblé au-delà de 800 composés différents à travers plus de 1600 différentes expériences, créant le plus vaste répertoire de signatures chimio-génomiques humain. Cet ensemble de données permettra de futures comparaisons entre divers cribles, facilitant la prédiction de mécanismes d’action et l’interprétation des résultats chimio-génomiques.
Services offerts :
- Criblages combinés CRISPR/Cas9 KO faits en présence de composés inhibant la prolifération cellulaire (criblages chimio-génomiques)
- Criblages de génétique double : KO d’un gène d’intérêt multiplexé avec le knockout de tous les gènes pour un crible d’essentialité génique
- Support pour le séquençage et l’analyse de tout autre type de crible CRISPR/Cas9 KO combiné (séquençage de guides et calcul de scores génique d’enrichissement/déplétion)
Équipements :
- Thermocycleurs BioRad T-100
- Manipulateur de liquides par acoustique Echo 525 (plateforme de criblage à haut débit)
- Séquenceur Illumina Nextseq 2000 (plateforme génomique)
- Collection exhaustive de « Spinner Flasks »
- Agitateur 4 positions à faible vitesse pour culture cellulaire, CimarecBiosystem plus Biomodul 40B
- Incubateurs CO2
- Hottes stériles à flux laminaire
- Librairies d’ARN guides combinées ciblant tous les gènes : EKO et TKOv3