Plateforme

Criblage à haut débit

La plateforme de Criblage à haut débit permet d’exécuter une variété d’essais biochimiques et cellulaires. Elle offre une très grande polyvalence dans le type d’essais pouvant y être développé ainsi que la miniaturisation et l’automatisation de ces derniers.

Elle permet d’identifier de nouvelles molécules spécifiques et les cibles d’intérêt dans le cadre de projets de recherche fondamentale et médicale. Elle offre également une expertise dans les phases précoces de projets de découvertes de molécules à potentiel thérapeutique.

Contact
Jean Duchaine
Téléphone (bureau)
(514) 343-6111, p. 0649
Courriel
jean.duchaine@umontreal.ca

Services offerts :

  • Optimisation et validation d’essais
  • Criblage primaire et secondaire (capacité de criblage allant jusqu’à 25 000 tests par jour)
  • Accès à une banque de composés chimiques à application étendue en provenance de sources commerciales et internes
  • Analyse des données et préparation de rapport
  • Conseils relatifs au format d’essai et au mode de détection le plus approprié

Équipement

Caractéristiques des librairies

  • Chembridge DiverSet : 60000 composés (chembridge.com)
  • Maybridge HitFinder™ : 16000 composés
  • Maybridge (sélectionnés) : 16000 composés (maybridge.com)
  • SPECS (sélectionnés) : 16000 composés (specs.net)
  • Microsource Discovery Spectrum : 2000 composés (msdiscovery.com)
  • Biomol (produits naturels) : 500 composés (biomol.com)
  • Prestwick (produits commercialisés) : 1120 composés (prestwickchemical.fr)
  • SIGMA LopacTM : 1280 (sigmaaldrich.com)
  • Collection interne (synthétisés à l’UdeM) : 8000 composés

Station de pipettage semi-automatique

  • Station de pipettage Fluent 780 équipée d’une tête MCA 96-puits et d’une tête FCA (8 tips) avec lecteur de code à barres (Tecan)
  • Un stacker carrousel (jusqu’à 120 microplaques)
    • Installé dans une hotte biologique de classe II

Système de criblage à haut contenu d’information (High content screening) Opera (Perkin-Elmer) avec logiciel d’analyse Acapella 2.6

  • Objectifs : 20X air, 20X , 40X et 60 X (immersion à l’eau)
  • Lasers :
    • Bleu : 488 nm
    • Jaune : 561 nm
    • Rouge : 640 nm
    • Violet: 445 nm
    • Lampe UV: 360-410 nm
    • T-LED: 690 nm
    • Camera 1 High QE CCD
    • Camera 2 High QE CCD
    • Camera 3 High QE CCD
    • Camera 4 Camera UV
    • Intégré avec un robot Plate-Handler VP5243M (Perkin-Elmer)
    • Hôtel 42 positions
    • Unité de contrôle de la température, du CO2 et de l’humidité

Système de criblage fonctionnel Hamamatsu FDSS 7000

  • 2 têtes de pipettage 384-puits (1-30µl)
  • Caméra EM-CCD haute sensibilité
  • Capture d’images de plaques de 384 puits entières
  • Taux d’échantillonnage 10 Hz (10 lectures par secondes)
  • Système de lavage d’embouts
  • Filtres

Système robotique intégré 1 (VAL Thermo)

  • Station de pipettage Fluent 480 équipé d’une tête MCA 96-puits (Tecan)
  • Station de transfert de composé acoustique Echo 555 (Labcyte)
  • Distributeur en vrac : Multidrop Combi (Thermo)
  • Distributeur en vrac : Multiflo FX (Biotek)
  • Laveur de plaques TS405 (compatible avec plaques de 96- et 384 puits) (Biotek)
  • Incubateur à CO2 Cytomat 6001 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 189 microplaques)
  • Carrousel ambiant (jusqu’à 120 microplaques)
  • Lecteur de codes à barres
  • Lecteur de plaques Envision (Perkin-Elmer) :
    • Densité optique
    • Luminescence et luminescence accrue
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET
    • AlphaScreen
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits
  • Lecteur de plaques Synergy NEO (Biotek) :
    • Luminescence
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET I et II
    • HTRF
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits

Système robotique intégré 2 (bras robotisé CRS F3 de Thermo)

Installés dans une hotte biologique de classe II :

  • Stations de pipettage Biomek NX (Beckman) équipé d’une tête 96-puits/250μl et Biomek NX équipé d’une tête “Span-8”
  • Distributeur en vrac : Multidrop Combi (Thermo)
  • Distributeur en vrac : Multiflo FX RAD (Biotek)
  • Laveur de plaques TS405 (compatible avec plaques de 96- et 384 puits) (Biotek)
  • Centrifugeuse de microplaques V-Spin
  • Incubateur à CO2 Cytomat 6001 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 140 microplaques)
  • Incubateur à température ambiante ou réfrigéré Cytomat 6002 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 140 microplaques)
  • Carrousel ambiant (jusqu’à 88 plaques ou boîtes d’embouts)
  • Lecteur de barcodes
  • Lecteur de plaques NEO (Biotek) :
    • Luminescence
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET I et II
    • HTRF
    • AlphaScreen
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits

 

Analyse et stockage des données

  • Gestion des données biologiques et chimiques, analyses statistiques et calculs IC50 :
    • Suite ActivityBase ver. 9.1 de IDBS
    • Serveur IBM System x3650 M4
  • Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2630 v2 @ .60GHz (24 CPUs), ~2.6GHz (32 Go de mémoire vive)
  • Stockage de données sur environnement de fibre optique (Solution de redondance RAID intégrée)

Instruments additionnels

  • Thermosealer Plateloc (Agilent)
  • Laveur de plaques ELx405 (compatible avec plaques de 96- et 384 puits) (Biotek)
  • 2 distributeurs en vrac : Multidrop Combi (Thermo)
  • Distributeur en vrac : Multidrop Combi nl (Thermo)

Personnel