Plateforme

Criblage à haut débit

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La plateforme de criblage à haut débit accompagne les chercheurs du monde académique et industriel dans la découverte de nouvelles molécules et de nouvelles cibles, depuis les phases exploratoires initiales jusqu’aux campagnes de criblage à grande échelle. Nous développons, miniaturisons et automatisons une vaste gamme de tests, allant des mesures biochimiques et cellulaires à l’imagerie à haut contenu (HCI) et autres approches de profilage multidimensionnel. Notre équipe conjugue des compétences en criblage, en automatisation et en analyse de données pour aider nos partenaires à identifier des composés et des gènes d’intérêt, ainsi que pour soutenir les projets de découverte de médicaments en phase précoce.

Contact
Simon Mathien
Téléphone (bureau)
(514) 343-6111, p. 0649
Télécopieur
(514) 343-7780
Courriel
simon.mathien.1@umontreal.ca

Services offerts :

  • Gestion de chimiothèques : Chimiothèques de petites molécules et de génomique fonctionnelle (shRNA, CRISPR, ORF) ; hébergement de chimiothèques pour des partenaires académiques et industriels.
  • Développement de tests : Du concept au test prêt pour le criblage : conception, miniaturisation, automatisation, validation et procédures opérationnelles normalisées (SOP).
  • Criblage automatisé : Flux de travail entièrement automatisés, allant de séries ciblées à des campagnes de grande envergure, incluant la génération de jeux de données multidimensionnels pour des applications d’IA.
  • Analyse de données : Contrôle qualité (QC), normalisation et sélection de « hits », avec des pipelines personnalisés pour le profilage par imagerie et la transcriptomique.
  • Développement technologique : Nouvelles technologies de criblage, nouvelles approches méthodologiques (NAM), profilage multi-omique et études de preuve de concept.

Équipement

Description des chimiothèques

  • Chimiothèques commerciales de criblage (Chembridge DiverSet, Maybridge Hitfinder, SPECS) :
    • Composés sélectionnés (propriétés de type médicament) 77000
    • Fragments (masse moléculaire < 250) 14000
    • Sélection secondaire (squelettes moléculaires non conventionnels) 11000
  • Sous-chimiothèques ciblées
    • Chembridge GPCR Library 5000
    • Maybridge BioactiveV2 Library 700
      Maybridge Cytotoxic Library 100
    • Maybridge (sélection personnalisée) 1000
  • Chimiothèques de composés bioactifs ou destinés au repositionnement
    • Microsource Discovery Spectrum 2000
    • Biomol (produits naturels) 700
    • Prestwick (approuvés par la FDA et l’EMA) 1100
    • Sigma LOPAC 1280 1300
    • ApexBio L1048 2000
    • Selleckhem L1300 (approuvés par la FDA) 2700
  • Composés exclusifs de l’UdeM 9000

 

Système robotique entièrement intégré 1 (Spinnaker 3, Thermo Fisher)

  • Station de transfert acoustique Echo 555 (Labcyte)
    • Système de manipulation de liquides Fluent 480 (Tecan)
    • Distributeurs en vrac : Multidrop Combi (Thermo Fisher), MultiFlo FX (BioTek)
    • Laveur de plaques : 405 TS (BioTek)
    • Incubateur CO2 automatisé Cytomat C10 (Thermo Fisher)
    • Carrousel à température ambiante (jusqu’à 120 microplaques)
    • Lecteur de plaques Synergy Neo (BioTek)
    • Imageur à haut contenu CellVoyager CQ1 (Yokogawa)

Système robotique entièrement intégré 2 (F7, Thermo Fisher)

  • Système de manipulation de liquides Biomek NX (Beckman Coulter), sous poste de sécurité biologique
  • Distributeurs en vrac : Multidrop Combi (Thermo Fisher), MultiFlo FX RAD (BioTek)
  • Laveur de plaques : 405 TS (BioTek)
  • Centrifugeuse de microplaques VSpin (Agilent)
  • Incubateur CO2 automatisé Cytomat C5 (Thermo Fisher)
  • Carrousel à température ambiante
  • Lecteur de plaques Synergy Neo (BioTek)

Station de pipetage semi-automatisée, sous poste de sécurité biologique de classe II

  • Système de manipulation de liquides Fluent 780 (Tecan)
  • Unité de stockage à température ambiante Cytomat C10 (Thermo Fisher)

Imageur à haut contenu Opera (PerkinElmer)

  • Objectifs : 20X à air ; Objectifs à immersion dans l’eau (20x, 40x et 60x)
  • Contrôle de l’environnement (température, CO2 et humidité)
  • Manipulateur de plaques VP5243M (PerkinElmer) avec magasin de 42 positions

Système de criblage fonctionnel FDSS 7000 (Hamamatsu)

  •  Caméra EM-CCD haute sensibilité, imagerie de plaques complètes de 384 puits
  • Cadence d’échantillonnage jusqu’à 10 Hz (10 lectures par seconde)
  • Deux têtes de pipetage pour plaques de 384 puits

Système d’analyse d’interactions sans marquage OctetRed 384 (Sartorius)

  • Interférométrie en couche biologique (BLI) pour l’analyse en temps réel et sans marquage d’interactions biomoléculaires
  • Cinétique de liaison, détermination de l’affinité et quantification de protéines

Systèmes d’analyse de cellules vivantes Incucyte S3 et SX5 (Sartorius)

  • Imagerie automatisée à long terme de cellules vivantes au sein d’un incubateur à CO2 standard
  • Imagerie en contraste de phase et en fluorescence multicanal
  • Jusqu’à 6 microplaques par instrument
  • Applications incluant la prolifération, la cytotoxicité, la lyse cellulaire par des cellules immunitaires et l’étude de la morphologie au cours du temps

Stockage de données biologiques et chimiques

ActivityBase Suite version 9.1 (IDBS)

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