Protéomique

La plateforme de protéomique de l’IRIC offre un service d’analyse de protéines par nanochromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse hybride (nanoLC-MS/MS). La plateforme a été conçue de manière à maximiser le débit d’analyse tout en ayant la possibilité de détecter de faibles quantités de peptides (20 fmol). Le but premier de la plateforme est de permettre l’identification de protéines contenues dans des bandes de gel 1D. Les personnes intéressées pourront fournir les échantillons qui seront séparés par électrophorèse sur gel dans notre laboratoire ou donner des bandes 1D à analyser directement. Aussi, il sera possible dans le cadre de collaboration de faire du profil d’expression protéique ou de l’identification ciblée de modifications post-traductionnelles (phosphorylation et glycosylation).  Au cas ou l’analyse par électrophorèse sur gel ne soit pas désirée, il sera également possible d’analyser les échantillons par chromatographie bi-dimensionnelle combinant chromatographie échangeuses d’ions et chromatographie en phase inverse. La plateforme fournira également une formation aux étudiants et stagaires post-doctoraux de l’IRIC en ce qui a trait à l’analyse d’échantillons par nano-LC-MS/MS.

Cliquez ici pour consulter le site web de la plateforme de protéomique de l’IRIC.

Aperçu des services offerts

  • Séparation de protéines par électrophorèse sur gel à une dimension
  • Digestion des bandes avec la trypsine
  • Tryptic digestion
  • Identification des protéines par LC-MS/MS et analyses bio-informatiques
  • Analyse par 2D-LC-MS/MS de digestats tryptiques de mélanges complexes de protéines
  • Identification des protéines avec Mascot.
  • Détection de modifications post-traductionnelles

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