Plateforme

Bio-Physique/RMN

La plateforme de Bio-Physique/RMN fournit une solution d’avant-garde en spectrométrie par RMN avec un focus sur les expériences basées sur l’étude de la structure des protéines, des interactions protéine-ligand et des analyses de routine de petites molécules.

Contact
Michael Osborne
Téléphone (bureau)
(514) 343-6111, p. 0534
Courriel
michael.osborne@umontreal.ca

Services offerts :

  • Analyse d’échantillons par RMN et analyse des spectres
  • Accès aux scripts maison pour faciliter l’analyse des données de RMN
  • Conseils et formation aux usagers pour :
    • Incorporation d’isotopes stables et purification de protéines
    • Élaboration de stratégies visant la détermination de structures de protéines et de petites molécules ainsi que l’étude de complexes protéine-ligand
    • Traitement et interprétation des spectres RMN
    • Utilisation de logiciels pour générer des structures 3D à partir de données provenant d’études de RMN
    • Acquisition automatisée de spectres pour de petites molécules
      • Spectres 1D de noyaux allant de 15N à 31P, comprenant 1H
      • Spectres 2D, incluant COSY, NOESY, ROESY, HSQC, HMQC, HMBC, expériences H2BC
  • Mise en œuvre d’expériences de RMN pour l’assignation et la détermination de structure de protéines, incluant notamment :
    • Spectre pour la structure principale; HNCACB, HNCA, la LCSA (CO) NH, HNCOCA, HNCO, etc
    • Spectre pour l’attribution des groupements; C (CO) NH-TOCSY, HC (CO) NH-TOCSY, HCCH-TOCSY, etc
    • Spectre pour la production de contraintes structurelles; 2D, 3D, 4D 15N et 13C-édité NOESY, HNHA, HNHB
  • Mise en œuvre de méthodes innovantes pour la réalisation d’expériences de RMN en accéléré y compris les acquisitions non-linéaires et les méthodes rapides SO-FAST
  • Détermination de couplages dipolaires : IPAP-HSQC
  • Accès au spectre pour étudier la liaison d’une petite molécule à des protéines; expériences MST 1D et 2D, expériences SDC 2D, expériences T1rho 1D, expériences de titration 2D 1H-15N HSQC. Expériences 3D avec sélection de filtres

Équipement

Bruker 600 MHz Avance III HD RMN équipé d’une sonde froide réglable 1H-19F QCIP 5mm ou sonde froide 1.7mm TCI avec chargeur d’échantillons refroidissant.

  • Études de biologie structurale, biologie chimique, petites molécules et criblage de fragments (collection de fragments de Maybridge and Key Organics)

400 MHz MR Varian automatisé

  • Pipeteur automatisé de 96 échantillons
  • Deux canaux RF
  • Sonde 5mm OneNMR avec sensibilité 1H and 13C accrue
  • Détection des noyaux de 15N à 31P

Personnel