Plateforme

Génomique

La plateforme de Génomique offre une gamme de services qui combine conseils et accès à des technologies de pointe dans le domaine de la génomique. Les prestations offertes vont de la préparation des échantillons à la séquence de base, à la génération de très grands volumes de données de séquençage nouvelle génération (NSG).

La plateforme propose un service complet de PCR en temps réel et de Digital Droplet PCR (ddPCR), avec l’extraction de l’ARN aux résultats finaux et travaille en étroite collaboration avec la Plateforme de Bio-informatique de l’IRIC.

Contact
Raphaëlle Lambert
Téléphone (bureau)
(514) 343-6111, p. 53313
Courriel
raphaelle.lambert@umontreal.ca

Services offerts :

  • Séquençage par capillaire
  • Séquençage d’ADN (plasmides, produits PCR, etc.)
    • Résultats fournis en 48 h et accès personnalisé aux séquences sur un serveur sécurisé
  • PCR en temps réel (qPCR) et Digital Droplet PCR (ddPCR)
  • Séquençage de nouvelle génération
    • RNASeq
    • Amplicons
    • Petits ARNs (miRNAs)
    • Régions génomiques ciblées (séquençage d’exomes)
    • ChIP-seq (immunoprécipitation et séquençage de la chromatine)
    • Séquençage de l’ADN génomique (génome complet)
  • Accès à un service conseils sur la stratégie de séquençage optimale à adopter et le design expérimental
  • Validation et analyse des résultats
  • Analyse de l’ADN et de l’ARN
  • Analyse de la qualité et quantité de l’ARN (rapport complet en format PDF, Indice de qualité RIN pour l’ARN)

Équipement

Séquençage Sanger

DNA analyzer ABI 3730

Séquençage de nouvelle génération

Illumina NextSeq500
Illumina MiSeq

qPCR

Life Technologies ViiA 7
Life Technologies QuantStudio 7 Flex
Roche LC480

Analyse de la qualité et quantité d’ARN

Agilent Bioanalyzer 2100

Spectrophotomètre

NanoDrop 8000

PCR digital

Biorad QX200

Sonicateur

Covaris S-series

Stations de pipettage semi-automatique

Biomek FX
EpiMotion

Personnel