Biophysique

La plateforme de biophysique de l’IRIC fournit une solution d’avant-garde en spectroscopie par RMN avec un accent particulier sur les expériences portant sur l’étude de la structure des protéines, des interactions protéine-ligand et des analyses de routine de petites molécules. La plateforme possède deux spectromètres de RMN de Varian: un 600 MHz INOVA équipé d’une sonde froide HCN principalement dédiée aux grosses molécules (protéines / acides nucléiques) et un 400 MHz MR avec un système automatisé de présentation d’échantillons couramment utilisé pour l’analyse de petites molécules.

 

 

Aperçu des services offerts

Nous offrons des services d’analyse d’échantillons par RMN et d’assistance pour l’analyse des spectres. Nous offrons également des conseils et de la formation aux usagers pour :

  • l’expression, l’incorporation d’isotopes stables et la purification de protéines
  • l’élaboration de stratégies visant la détermination de structures de protéines et de petites molécules ainsi que l’études de complexes protéine-ligand
  • le traitement et l’interprétation des spectres RMN
  • l’utilisation de logiciels pour générer des structures 3D à partir de données provenant d’études de RMN
  • l’acquisition automatique de spectres pour de petites molécules

Nous offrons aussi des conseils et la mise en œuvre d’expériences de RMN pour l’assignation et la détermination de structure de protéines, incluant notamment:

  • Spectre pour la structure principale; HNCACB, HNCA, la LCSA (CO) NH, HNCOCA, HNCO, etcSpectre pour l’attribution des groupements; C (CO) NH-TOCSY, HC (CO) NH-TOCSY, HCCH-TOCSY etc
  • Spectre pour la production de contraintes structurelles; 2D, 3D, 4D 15N et 13C-édité NOESY, HNHA, HNHB
  • Mise en œuvre de méthodes dernier cri pour la réalisation d’expériences de RMN en accéléré y compris les acquisition non-linéaires et les méthodes rapides SO-FAST
  • Détermination de couplages dipolaires; IPAP-HSQC
  • Spectre pour étudier la liaison d’une petite molécule à des protéines; expériences MST 1D et 2D, expériences SDC 2D, expériences T1rho 1D, expériences de titration 2D 1H-15N HSQC. Expériences 3D avec sélection de filtres
  • Conseils sur l’expression, le marquage uniforme et la purification de protéines
  • Conseils et aide sur le traitement et l’interprétation des spectres RMN
  • Accès de  scripts maison pour faciliter l’analyse des données de RMN

Nous fournissons également une formation pour les usagers pour utiliser le système automatisé du RMN 400 MHz pour les spectres de routine de petites molécules, y compris :

  • Spectres 1D de noyaux allant de 15N à 31P, comprenant 1H
  • Spectres 2D, incluant COSY, , NOESY, ROESY, HSQC, HMQC, HMBC, expériences H2BC

 

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